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Sampling-Importance-Resampling algorithm

작성일자 고감자님이 작성

Sampling-Importance-Resampling algorithm 어제에 이어 Sampling-Importance-Resampling algorithm 코드를 올려본다. 물론 책의 코드를 참고했는데, R코드를 구현하다 보니 거의 pseudo코드에 근접하는 것을 알 수 있었다. 이는 시뮬레이션과 데이터에 최적화된 R의 특징 때문이라 생각된다. 특히나 가중치 값에 따라 resampling하는 부분이 함수 하나로 치환되었고 컴퓨팅 속도도 무척 빨라졌다. weight값에 따라 재 샘플링하는 부분이 어떻게 동작하는지 comment된 부분을 참고하는 것도 좋을거 […]

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Rejection Sampling 시뮬레이션

작성일자 고감자님이 작성

rejection sampling 겨울학교에서 Gibbs Sampling 방법론에 대한 내용이 나와서 이게 바이오정보학과목에서 본거 같은데 확실한 의미를 몰라서 찾아보다가 여러 샘플링 기법에 대해서 살펴보고 있다. 대부분 복잡한 확률 모델들은 확률값을 추론하기가 힘들다. 이 때문에 여러 샘플링 방법을 사용해서 확률값을 근사하는게 되는데, 책을 보다가 책에 있는 코드를 기반 R로 시뮬레이션을 해봤다. 함수가 있는데 이런식으로 시뮬레이션 샘플링을 하는 이유는 […]

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